Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms