Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lin52Q8CD94 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lin52Q8CD94 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Lin52Q8CD94 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin52Q8CD94 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin52Q8CD94 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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