Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms