Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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