Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms