Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tnfsfm13Q8BXS2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tnfsfm13Q8BXS2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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