Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms