Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms