Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp54Q8BL06 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms