Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms