Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms