Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms