Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms