Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srgap3Q812A2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms