Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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