Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms