Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf8Q80TJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms