Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ube2q1Q7TSS2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2q1Q7TSS2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Ube2q1Q7TSS2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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