Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms