Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms