Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms