Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mindy1Q76LS9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms