Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpd4Q6ZPR5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms