Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asic3Q6X1Y6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asic3Q6X1Y6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms