Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms