Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrlQ6PE55 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms