Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Zbtb40Q6PCS8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbtb40Q6PCS8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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