Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amer3Q6NS69 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amer3Q6NS69 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms