Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms