Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw2Q6I6G8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw2Q6I6G8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms