Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms