Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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