Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms