Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q66JV7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q66JV7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q66JV7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q66JV7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q66JV7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q66JV7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q66JV7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q66JV7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms