Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpgs2Q66JT5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms