Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms