Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3bQ62177 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms