Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms