Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik5Q61626 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik5Q61626 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms