Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms