Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms