Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms