Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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