Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms