Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Akap4Q60662 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms