Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1h2Q60644 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms