Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms