Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms