Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms