Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms